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https://repositorio.museu-goeldi.br/handle/mgoeldi/2750
metadata.dc.type: | Artigo de Periódico |
Title: | Exploring the potentiality of natural products from essential oils as inhibitors of odorant-binding proteins: a structure- and ligand based virtual screening approach to find novel mosquito repellents. |
Other Titles: | Explorando o potencial de produtos naturais de óleos essenciais como inibidores de proteínas de ligação a odorantes: uma abordagem de triagem virtual baseada em estrutura e ligante para encontrar novos repelentes de mosquitos. |
metadata.dc.creator: | Costa, Kauê Santana da Nascimento, Lidiane Diniz do |
metadata.dc.description.resumo: | Odorant-binding proteins (OBPs) are the main olfactory proteins of mosquitoes, and their structures have been widely explored to develop new repellents. In the present study, we combined ligand- and structure-based virtual screening approaches using as a starting point 1633 compounds from 71 botanical families obtained from the Essential Oil Database (EssOilDB). Using as reference the crystallographic structure of N,N-diethyl-meta-toluamide interacting with the OBP1 homo dimer of Anopheles gambiae (AgamOBP1), we performed a structural and pharmacophoric similarity search to select potential natural products from the library. Thymol acetate, 4-(4-methyl phenyl)-pentanal, thymyl isovalerate, and p-cymen-8-yl demonstrated a favorable chemical correlation with DEET and also had high-affinity interactions with the OBP binding pocket that molecular dynamics simulations showed to be stable. To the best of our knowledge, this is the first study to evaluate on a large scale the potentiality of NPs from essential oils as inhibitors of the mosquito OBP1 using in silico approaches. Our results could facilitate the design of novel repellents with improved selectivity and affinity to the protein binding pocket and can shed light on the mechanism of action of these compounds against insect olfactory recognition. |
Abstract: | Proteínas de ligação a odorantes (OBPs) são as principais proteínas olfativas de mosquitos, e suas estruturas têm sido amplamente exploradas para o desenvolvimento de novos repelentes. No presente estudo, combinamos abordagens de triagem virtual baseadas em ligantes e estruturas, utilizando como ponto de partida 1633 compostos de 71 famílias botânicas obtidos do Banco de Dados de Óleos Essenciais (EssOilDB). Utilizando como referência a estrutura cristalográfica da N,N-dietil-meta-toluamida interagindo com o homodímero OBP1 de Anopheles gambiae (AgamOBP1), realizamos uma busca de similaridade estrutural e farmacofórica para selecionar potenciais produtos naturais da biblioteca. Acetato de timol, 4-(4-metil fenil)-pentanal, isovalerato de timila e p-cimen-8-il demonstraram uma correlação química favorável com DEET e também tiveram interações de alta afinidade com o sítio de ligação OBP, que simulações de dinâmica molecular mostraram ser estáveis. Até onde sabemos, este é o primeiro estudo a avaliar em larga escala o potencial de NPs de óleos essenciais como inibidores do OBP1 do mosquito, utilizando abordagens in silico. Nossos resultados podem facilitar o desenvolvimento de novos repelentes com maior seletividade e afinidade pela região de ligação proteica, além de esclarecer o mecanismo de ação desses compostos contra o reconhecimento olfativo de insetos. |
Keywords: | Proteinas de ligação a odorantes Repelentes |
metadata.dc.subject.cnpq: | CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::BOTANICA |
metadata.dc.language: | por |
metadata.dc.publisher.country: | Brasil |
Publisher: | Museu Paraense Emílio Goeldi |
metadata.dc.publisher.initials: | MPEG |
Citation: | COSTA, Kauê Santana da et al. Exploring the potentiality of natural products from essential oils as inhibitors of odorant-binding proteins: a structure- and ligand- based virtual screening approach to find novel mosquito repellents. ACS Omega, v. 4, n. 27, p. 22475–22486, 2019. |
metadata.dc.rights: | Acesso Aberto |
URI: | https://repositorio.museu-goeldi.br/handle/mgoeldi/2750 |
Issue Date: | 17-Dec-2019 |
Appears in Collections: | Botânica - Artigos Publicados em Periódicos |
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