Unraveling the plant diversity of the Amazonian canga through DNA barcoding

Vasconcelos, Santelmo; Nunes, Gisele L.; Dias, Mariana C.; Gil, André dos Santos Bragança

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DC Field	Value	Language
dc.creator	Vasconcelos, Santelmo	-
dc.creator	Nunes, Gisele L.	-
dc.creator	Dias, Mariana C.	-
dc.creator	Gil, André dos Santos Bragança	-
dc.date.accessioned	2025-02-17T17:54:29Z	-
dc.date.available	2025-01-06	-
dc.date.available	2025-02-17T17:54:29Z	-
dc.date.issued	2021-08-11	-
dc.identifier.citation	VASCONCELOS, Santelmo et al. Unraveling the plant diversity of the Amazonian canga through DNA barcoding. Ecology and Evolution, v. 11, p. 13348-13362, 2021.	pt_BR
dc.identifier.issn	2045-7758	pt_BR
dc.identifier.uri	https://repositorio.museu-goeldi.br/handle/mgoeldi/2568	-
dc.description.abstract	A canga da Serra dos Carajás, na Amazônia Oriental, abriga um ambiente aberto único comunidade vegetal, abrigando diversas espécies endêmicas e raras. Embora seja um completo estudo da flora foi publicado recentemente, há pouca ou nenhuma informação genética disponível para a maioria das espécies vegetais dos afloramentos ferruginosos da Serra dos Carajás. Em Neste cenário, o código de barras do DNA aparece como uma abordagem rápida e eficaz para avaliar o diversidade genética da flora da Serra dos Carajás, considerando a crescente necessidade de planeamento robusto da conservação da biodiversidade numa área com actividades de mineração industrial. Assim, depois de testar oito marcadores de código de barras de DNA diferentes (matK, rbcL, rpoB, rpoC1, atpF-atpH, psbK-psbI, trnH-psbA, e ITS2), escolhemos rbcL e ITS2 como marcadores mais adequados para ampla aplicação na flora regional. Aqui nós descrevemos Códigos de barras de DNA para 1.130 espécimes de 538 espécies, 323 gêneros e 115 famílias de plantas vasculares de uma flora altamente diversificada na bacia amazônica, com um total de 344 espécies sendo codificadas em barras pela primeira vez. Além disso, avaliamos o potencial de usando metabarcoding de DNA de amostras em massa para levantamento da diversidade de plantas na canga. Ao alcançar o primeiro esforço abrangente de código de barras de DNA direcionado para uma completa flora da Amazônia brasileira, discutimos a relevância de nossos resultados para orientar futuras medidas de conservação na Serra dos Carajás.	pt_BR
dc.language	eng	pt_BR
dc.publisher	Museu Paraense Emílio Goeldi	pt_BR
dc.relation.ispartof	Ecology and Evolution	pt_BR
dc.rights	Acesso Aberto	pt_BR
dc.subject	Bacia Amazônica	pt_BR
dc.subject	Carajás	pt_BR
dc.subject	Códigos de Barras de	pt_BR
dc.subject	ITS2	pt_BR
dc.subject	RBCL	pt_BR
dc.subject	Plantas Vasculares	pt_BR
dc.title	Unraveling the plant diversity of the Amazonian canga through DNA barcoding	pt_BR
dc.title.alternative	Desvendando a diversidade vegetal da canga amazônica através Código de barras de DNA	pt_BR
dc.type	Artigo de Periódico	pt_BR
dc.citation.volume	11	pt_BR
dc.citation.issue	0	pt_BR
dc.citation.spage	13348	pt_BR
dc.citation.epage	13362	pt_BR
dc.description.resumo	The canga of the Serra dos Carajás, in Eastern Amazon, is home to a unique open plant community, harboring several endemic and rare species. Although a complete flora survey has been recently published, scarce to no genetic information is available for most plant species of the ironstone outcrops of the Serra dos Carajás. In this scenario, DNA barcoding appears as a fast and effective approach to assess the genetic diversity of the Serra dos Carajás flora, considering the growing need for robust biodiversity conservation planning in such an area with industrial mining activities. Thus, after testing eight different DNA barcode markers (matK, rbcL, rpoB, rpoC1, atpF-atpH, psbK-psbI, trnH-psbA, and ITS2), we chose rbcL and ITS2 as the most suitable markers for a broad application in the regional flora. Here we describe DNA barcodes for 1,130 specimens of 538 species, 323 genera, and 115 families of vascular plants from a highly diverse flora in the Amazon basin, with a total of 344 species being barcoded for the first time. In addition, we assessed the potential of using DNA metabarcoding of bulk samples for surveying plant diversity in the canga. Upon achieving the first comprehensive DNA barcoding effort directed to a complete flora in the Brazilian Amazon, we discuss the relevance of our results to guide future conservation measures in the Serra dos Carajás.	pt_BR
dc.publisher.country	Brasil	pt_BR
dc.publisher.initials	MPEG	pt_BR
dc.subject.cnpq	CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::BOTANICA	pt_BR
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